Fylogenie is de studie van de afstamming van organismen. In een fylogenetische stamboom wordt grafisch weergegeven welke groepen organismen van eerdere gemeenschappelijke voorouder afstamt.

Vroeger werd de afstamming grotendeels bepaald aan de hand van uiterlijke kenmerken of aan de hand van embryonale ontwikkelingen. Bij groepen met nog levende exemplaren gebeurt dat momenteel aan de hand van DNA onderzoek.